En julio de 2025, el gobierno de Boric le exigió la renuncia a Etcheberry, como director nacional del Servicio de Impuestos Internos (SII), ello debido a su  abultada y prolongada deuda por las contribuciones de bienes raíces de su casa-habitación, edificada en un terreno rural de 5.000 m2 en el sector de la laguna de Aculeo, comuna de Paine.